Trong khi đó ở bảng B, SLNA khởi đầu rất thuận lợi trước Thanh Hóa khi có bàn dẫn trước. Một chiến thắng là đủ để đội bóng từng 7 lần vô địch giành ngôi nhất bảng. Nhưng rút cuộc, SLNA đã để Thanh Hóa cân bằng được tỷ số 1-1, qua đó chỉ có 8 điểm sau vòng đấu bảng, nên đành phải đứng thứ nhì và trông chờ vào vận may qua cửa vé vớt.
Ở bảng C, chỉ cần cầm chân nhau là cả Sanna Khánh Hòa và PVF sẽ dắt tay nhau vào VCK. Đáng khen là cả 2 đội đã chơi một trận cầu sòng phẳng và PVF đã giành chiến thắng với tỷ số 4-2. Kết quả này cũng đồng nghĩa, PVF giành ngôi nhất bảng C với 12 điểm tuyệt đối sau vòng loại. Ở bảng D, ĐT.LA vượt qua Tiền Giang với tỷ số 6-2 trong khi TP.HCM đánh bại An Giang 2-1.
Dừng bước ngay vòng bảng, nên niềm vui như thế này của SLNA ở VCK chỉ là quá khứ
Như vậy, 4 đội đứng đầu 4 bảng là Viettel, Bình Định, PVF và Bình Dương đã giành 4 vé trực tiếp dự VCK. Do bảng A chỉ có 4 đội nên đội đứng nhì ở các bảng B, C và D phải trừ đi điểm số cũng như số bàn thắng-bại với đội thứ năm (tức đứng cuối) trong bảng đấu của mình. HN.T&T (6 điểm, hiệu số 7/2), SLNA (5 điểm), ĐT.LA (6 điểm, 7/6) và Sanna.KH (6 điểm, 10/6). Có điểm số thấp nhất trong số 4 đội nên SLNA là đội đầu tiên bị loại khỏi vòng so sánh các chỉ số tiếp theo. Đây là kết quả gây sốc bởi SLNA luôn được đánh giá rất cao.
Ba đội còn lại là HN.T&T, Sanna.KH và ĐT.LA đều cùng có 6 điểm nhưng HN.T&T và Sanna.KH có chỉ số phụ về hiệu số bàn thắng bại cao hơn nên đã giành 2 vé cho đội đứng nhì có thành tích tốt hơn dự VCK.
Như vậy, 8 đội dự VCK gồm Viettel, Bình Định, PVF, Bình Dương, HN.T&T, Sanna.KH, ĐKVĐ SHB Đà Nẵng và chủ nhà Thừa Thiên Huế. VCK sẽ diễn ra tại sân Tự Do, Thừa Thiên Huế, từ ngày 16-25/7 tới. Theo quy định chia bảng được diễn giải trong điều lệ thì kết quả cuối như sau: Bảng A gồm: Thừa Thiên Huế, HN.T&T, PVF, Bình Định. Bảng B gồm: SHB Đà Nẵng, Sanna Khánh Hòa, Viettel, Bình Dương.
Kết quả lượt cuối (tính đến 20h00 ngày 7/7)
Bảng A
Viettel – CAND: 2-2
HN.T&T – Quảng Ninh: 4-0
Bảng B
Thanh Hóa – SLNA: 1-1
Bảng C
Sanna.KH – PVF: 2-4
Đắk Lắk – Đồng Nai: 1-0
Bảng D
ĐT.LA – Tiền Giang: 6-2
TP.HCM – An Giang: 2-1