Từ rất sớm, Tiểu ban an ninh đã được VFF thành lập. Bên cạnh sự tham gia chủ lực và quyết định của Công an Hà Nội, còn có cả lực lượng vệ sỹ chuyên nghiệp do VFF thuê làm việc suốt thời gian diễn ra trận đấu. Đến thời điểm hiện tại, phương án an ninh cho trận đấu đã được hoàn tất. 

Theo thông tin từ VFF, công tác an ninh cho trận đấu của đội chủ nhà với ĐT Malaysia được đặt lên mức cao nhất. Hàng rào an ninh nhiều lớp sẽ được thiết lập tại sân Mỹ Đình. Theo đó, lực lượng an ninh sẽ tổ chức phân luồng giao thông từ sớm, đồng thời mở các cửa kiểm tra từ bên ngoài khuôn viên sân Mỹ Đình. Việc kiểm tra chất gây nổ, gây cháy và đặc biệt là pháo sáng, được yêu cầu thực hiện gắt gao. Lý do là VFF đã nhận lời cảnh báo từ AFC rằng, ĐT Việt Nam sẽ đối diện nguy cơ thi đấu trên sân trung lập hoặc sân không có khán giả, nếu xuất hiện tình trạng đốt pháo sáng trên sân Mỹ Đình trong trận đấu tới đây. Được biết, những trang thiết bị kiểm tra hiện đại nhất sẽ được Công an Hà Nội đưa đến sân Mỹ Đình. Bên cạnh đó, một lực lượng đông đảo nhân viên an ninh sẽ có mặt ở các cửa soát vé, trên khắp các khán đài, dưới sân, trong đường hầm nhằm đảm bảo an ninh và an toàn cho trận đấu.