Là cầu thủ trưởng thành từ lò đào tạo Stuttgart, Werner đã bộc lộ được tài năng từ khi còn rất trẻ. Bằng chứng là cầu thủ này từng ghi tới 32 bàn/37 trận cho đội U17 Stuttgart. Thành tích ấn tượng ấy giúp Werner được lên chơi ở đội U19 Stuttgart vào năm 2012/13 khi mới 16 tuổi.
Ở đội bóng mới, anh "nổ súng" 24 lần/24 trận và giành được huy chương Fritz Walter vàng là giải thưởng dành cho cầu thủ trẻ xuất sắc nhất nước Đức ở độ tuổi U17. Năm 2015, anh giành được huy chương Fritz Walter bạc ở đội U19.
Werner bắt đầu chơi cho đội 1 Stuttgart ở mùa 2013/14. Lúc đó anh mới 17 tuổi và còn chưa rời ghế nhà trường. Dù đã có cơ hội thử sức ở Bundesliga, Werner vẫn cố gắng lấy bằng tốt nghiệp thay vì bỏ học giữa chừng. Theo Werner thì anh rất tự hào khi làm được 2 việc quan trọng cùng một lúc.
Werner đá trận ra mắt đội 1 Stuttgart khi đội bóng này chạm trán Botev Plovdiv ở Europa League lúc mới 17 tuổi, 4 tháng 5 ngày. Trước đó, không có cầu thủ nào trẻ như anh từng chơi cho Stuttgart trong một trận đấu chính thức. Sau đó, Werner cũng trở thành cầu thủ Stuttgart trẻ nhất được góp mặt ở cúp quốc gia Đức.
Với cú dứt điểm làm tung lưới Eintracht Frankfurt, Werner là cầu thủ trẻ nhất ghi bàn cho Stuttgart. Chưa hết, anh còn là cầu thủ ít tuổi nhất chạm tới mốc chơi 50, 100 và 150 trận tại Bundesliga. Cuối cùng, Werner là cầu thủ trẻ nhất từng lập cú đúp trong 1 trận đấu ở sân chơi số 1 nước Đức.
Sau khi Stuttgart bị xuống hạng ở mùa 2015/16, Werner đã chia tay CLB sau 3 mùa gắn bó cùng đội 1. Chuyển đến Leipzig với giá 10 triệu euro, anh lập tức chứng minh giá trị khi ghi 21 bàn/31 trận ngay ở mùa giải đầu tiên khoác áo đội bóng mới.
Chiến tích ghi 33 bàn/45 trận ở các đội U của Đức giúp Werner có cơ hội đá trận ra mắt ĐTQG vào năm 2017 (anh đá 77 phút trận Đức gặp Anh). Trong trận đầu tiên ghi bàn cho ĐT Đức, Werner lập hẳn cú đúp giúp Cỗ xe tắng đánh bại Cameroon 3-1 ở Confederations Cup (6/2017).
Werner phải nhận vô số lời chỉ trích sau vụ anh bị tố diễn kịch để giúp Leipzig kiếm được 1 quả phạt đền, qua đó giành chiến thắng 2-1 trước Schalke hồi tháng 12/2016. Phản ứng quá gay gắt từ dư luận khiến Werner bị suy sụp tinh thần tới mức anh phải cần đến sự giúp đỡ của bác sỹ tâm lý.
Sau trận đấu nói trên, Werner khẳng định anh không cố tình ngã và thậm chí còn bảo với trọng tài rằng thủ môn Ralf Fahrmann chưa hề chạm vào mình. Tuy vậy trọng tài vẫn chỉ tay vào chấm phạt đền khiến rất nhiều trận sau đó Werner thường xuyên phải nhận những tiếng huýt sáo la ó từ khán đài.
Ở trận đấu trong khuôn khổ Champions League 2017/18 giữa Leipzig và Besiktas diễn ra trên SVĐ Vodafone Arena (Thổ Nhĩ Kỳ), Werner đã bị thay ra chỉ sau 32 phút bóng lăn. Các bức ảnh cho thấy Werner đã phải đeo nút tai và thường xuyên bịt tai vì không chịu nổi âm thanh quá lớn cùng bầu không khí thù địch trên khác khán đài. Theo BHL Leipzig thì họ buộc phải rút Werner ra từ sớm do cầu thủ này không thể liên lạc được với các đồng đội.
Werner từng được giới truyền thông Đức gán cho biệt danh "Turbo Timo" (tay đua siêu tốc) vì chạy quá nhanh. Anh nhanh tới mức có thể di chuyển hết quãng đường 100m chỉ sau 11 giây 11. Theo Werner, anh thích đẩy bóng về phía trước xa tới 3 hay 4 m để có thể thoải mái bứt tốc và "cắt đuôi" các hậu vệ.
Hồi còn là một cậu bé, Werner rất hâm mộ tiền đạo Mario Gomez (từng ghi 31 bàn/78 trận cho ĐT Đức từ năm 2007 đến 2018). Trong cuộc trả lời phỏng vấn trên trang Bundesliga.com, Werner thừa nhận vào năm 11 hay 12 tuổi anh có sở thích treo vô số ảnh của Gomez ở trong phòng.
Năm 2018, Werner từng tuyên bố anh rất háo hức được thi đấu cho một CLB nào đó ở giải Ngoại hạng Anh. Với việc vừa kiếm được tấm vé thông hành sang Chelsea, giấc mơ mà Werner ấp ủ bấy lâu nay giờ đã trở thành sự thật.
XEM THÊM
Chelsea đồng ý trả 53 triệu bảng phí giải phóng hợp đồng cho Werner
Liverpool làm gì sau khi để mất Werner vào tay Chelsea?
Liverpool đã biết phải ăn mừng thế nào nếu vô địch Premier League