Onana đã được chọn vào đội hình 24 cầu thủ Cameroon cho trận đấu tại vòng loại Cúp châu Phi gặp Burundi vào ngày 12/9. Cameroon chỉ cần không để thua là sẽ giành vé dự vòng chung kết bắt đầu từ ngày 13/1/2024 tại Bờ Biển Ngà.
Nếu Cameroon lọt vào giai đoạn sau của giải đấu, Onana sẽ vắng mặt trong các trận đấu của Man United gặp Tottenham, Wolves, West Ham và Aston Villa giai đoạn đầu năm 2024.
Trước đó, Onana cho biết anh sẽ kết thúc sự nghiệp thi đấu quốc tế vào tháng 12 năm ngoái ở tuổi 26. Onana bị loại sau khi bắt đầu trận đấu đầu tiên của Cameroon tại World Cup ở Qatar (trận thua 0-1 trước Thụy Sĩ) do bất đồng về chiến thuật với HLV Song, người đã yêu cầu các học trò cần phải "thể hiện tính kỷ luật và sự tôn trọng".
Cameroon sau đó hòa Serbia 3-3 và thắng Brazil 1-0 nhưng không thể vượt qua vòng bảng. Tuy nhiên, Onana đã thời điểm đó cũng khẳng định tình yêu với ĐT Cameroon.
Onana nói: "Tôi đã dồn hết tinh thần và sức lực để tìm ra giải pháp cho tình huống mà một cầu thủ bóng đá thường gặp phải, nhưng phía bên kia (HLV Song) lại không nghĩ thế. Các cầu thủ đến rồi đi, tên tuổi chỉ thoáng qua, nhưng Cameroon đến trước bất kỳ người nào hay cầu thủ nào. Cameroon vẫn là vĩnh cửu và tình yêu của tôi dành cho ĐTQG cũng vậy".