Công Phượng quyết định chia tay Yokohama FC sau hơn 1,5 năm gắn bó. Trong hơn 1 mùa giải khoác áo đội bóng này, Công Phượng không có nhiều cơ hội ra sân thi đấu. Chân sút sinh năm 1995 chỉ có vỏn vẹn 3 lần ra sân, trong đó có 1 lần đá chính, 2 lần dự bị, tổng 85 phút. Dẫu vậy, tiền đạo đến từ Việt Nam vẫn nhận được rất nhiều tình cảm của các đồng đội, thành viên BHL và nhân viên ở Yokohama FC. 

Trên trang cá nhân, một loạt đồng đội của Công Phượng ở Yokohama FC đã gửi lời chia tay anh. Bên cạnh đó, CLB Yokohama FC đã tổ chức một buổi chia tay cho cầu thủ sinh năm 1995. Ngoài việc có những lời khích lệ về chuyên môn, đánh giá cao tính cách, sự chuyên nghiệp, Yokohama FC cũng nhớ những ly cà phê mà Công Phượng dành cho các đồng đội.

“Nguyễn Công Phượng, người mà cùng chúng ta chiến đấu trong khoảng một năm rưỡi, sẽ rời đội trong ngày hôm nay. Mọi người đều yêu mến tính cách tốt bụng của Công Phượng và chắc chắn nhiều đồng đội sẽ cảm thấy buồn vì không thể uống được ly cà phê thơm ngon mà Công Phượng đã pha trong tủ đồ của mình. Trên sân, anh ấy cũng mạnh mẽ trước khung thành và thể hiện nhiều kỹ thuật tuyệt vời. Chúng tôi sẽ tiếp tục ủng hộ những thử thách tiếp theo của Công Phượng. Chúc may mắn!", đội bóng đang dẫn đầu BXH J.League 2 chia sẻ. 

Sau khi chia tay Yokohama FC, tương lai của Công Phượng nhận được sự quan tâm lớn. Có nhiều nguồn tin cho rằng Công Phượng đã đạt được thỏa thuận và sắp ký hợp đồng 3 năm với đội bóng tân binh của giải hạng Nhất – Trẻ TP.HCM Tuy nhiên, theo nguồn tin uy tín của Bongdaplus, quá trình thương thảo của hai bên đã đi vào bế tắc. Công Phượng mong muốn nhận được một lời đề nghị hấp dẫn hơn từ phía CLB Trẻ TP.HCM. Tuy nhiên, đội bóng này khẳng định không thể phá vỡ nguyên tắc về tài chính và thương vụ Công Phượng gia nhập Trẻ TP.HCM đã bị đổ bể.