Lê Phát được xem là một trong những học viên xuất sắc nhất của lò đào tạo bóng đá trẻ PVF thuộc lứa 2006 - 2007. Vào năm 2022, anh đã là trụ cột của đội U17 Việt Nam tham dự vòng loại U17 châu Á 2023 khi mới bước sang tuổi 15. Đó cũng là sân chơi giúp tên tuổi của Nguyễn Lê Phát bước ra ánh sáng.
Khi ấy, bộ đôi Lê Phát và Công Phương đã trực tiếp góp công giúp U17 Việt Nam giành vé vào vòng chung kết U17 châu Á 2023 với thành tích toàn thắng cả 3 trận. Đáng chú ý, Lê Phát đóng góp 2 pha lập công. Chứng kiến bộ kĩ năng xử lý bóng của Lê Phát cùng những tình huống đảo chân thanh thoát, người hâm mộ ngay lập tức liên tưởng đến tiền đạo Kylian Mbappe, người mới gia nhập Real Madrid. Từ thời điểm đó, biệt danh “Mbappe Việt Nam” gắn liền với Nguyễn Lê Phát.
Tuy nhiên, sau những ấn tượng ở vòng loại U17 châu Á 2023, Nguyễn Lê Phát đã trải qua quãng thời gian khó khăn. Tiền đạo sinh năm 2007 dính chấn thương liên miên và từ đó ảnh hưởng trực tiếp đến phong độ. Đó cũng là nguyên nhân anh thường xuyên vắng mặt trong các đợt tập trung của U17, U19 Việt Nam thời gian qua.
Mới đây, HLV Kim Sang Sik đã công bố danh sách 32 cầu thủ được triệu tập lên U22 Việt Nam nhằm chuẩn bị lực lượng hướng tới vòng loại U23 châu Á 2026 và SEA Games 33. Trong bản danh sách lần đầu được công bố, Nguyễn Lê Phát không được nhà cầm quân người Hàn Quốc triệu tập.
Tuy nhiên, sau khi chứng kiến màn trình diễn ấn tượng của Lê Phát ở trận chung kết giải U21 Quốc gia 2024 giữa PVF vs HAGL, HLV Kim Sang Sik đã quyết định triệu tập bổ sung “thần đồng” quê Đắk Nông lên U22 Việt Nam. Đây cũng là lần đầu tiên Lê Phát được triệu tập lên cấp độ U22, U23 Việt Nam.
Được biết, Lê Phát đã lên đường tập trung cùng toàn đội trong buổi sáng 14/8. Chiều cùng ngày, anh sẽ tham dự buổi tập đầu tiên cùng U22 Việt Nam vào lúc 17h00.