Trong trận đấu với Swansea hồi tháng 8/2015, HLV Mourinho đã nổi giận với Carneiro vì cho rằng cô đã tự tiện vào sân chăm sóc Eden Hazard khi cầu thủ này nằm sân. Sau đó, ông đã thẳng thừng “chửi mắng” nữ bác sĩ này ngay trên sân vì hành động tùy tiện đó.

Phát biểu trong buổi họp báo, HLV người Bồ Đào Nha bực dọc: “Tôi không hài lòng với những nhân viên của CLB. Ngay cả bạn là bác sĩ hay thư ký thì cũng phải hiểu rõ trận đấu. Khi bạn vào sân chăm sóc các cầu thủ thì bạn phải chắc chắn rằng cậu ta gặp vấn đề nghiêm trọng. Tôi chắc là Eden Hazard chẳng có vấn đề nghiêm trọng cả. Anh ta chỉ quá mệt thôi. Còn cô ta đã khiến chúng tôi lo lắng khi đối diện với tình huống phản công mà không có đủ người cần thiết”.

Bức xúc với cách hành xử của Mourinho, Carneiro quyết định nghỉ việc và đưa chuyện này ra tòa, khiến Chelsea và chiến lược gia người Bồ Đào Nha gặp vô số rắc rối. Cuối cùng, cô cũng được Chelsea bồi thường.

Tuy nhiên, tai ương chưa buông tha cho Carneiro. Tin đồn Carneiro là một người “cuồng sex” và từng quan hệ với một tiền đạo của Chelsea theo kiểu “tình một đêm” được phát tán. Thông tin trên được bạn trai cũ của Carneiro là Rupert Patterson-Ward tiết lộ. Người này cho biết đã từng cặp kè với nữ bác sĩ của Chelsea kể từ năm 2011 và chia tay vào năm 2013. Với Rupert Patterson-Ward, những tháng ngày bên Carneiro thực sự là một cơn ác mộng.

Năm 2016, Carneiro quyết định không làm bác sỹ cho bất kỳ CLB nào để đảm nhận công việc tại một phòng khám ở Gibraltar. Đến năm 2021, Carneiro trở lại với bóng đá nhưng với tư cách chủ sở hữu của Lewes FC, cùng Judy và Andy Murray với tư cách nhà đầu tư. Cô làm vậy khi nhìn thấy chiến dịch của họ có tên #CallHimOut được giương cao với chủ đề vấn đề bạo lực đối với phụ nữ.

Hiện tại, Carneiro đang có mặt ở Qatar và làm việc với Bệnh viện Y học Thể thao và Chỉnh hình Aspetar ở Qatar – nơi các cầu thủ thể thao thường xuyên được thăm khám, chẩn đoán và tư vấn về việc điều trị chấn thương trong thể thao thành tích cao.