Chuyển tới từ Blackburn năm 2011, Jones đã thi đấu 229 trận cho MU. "Ở tuổi 21, Jones trên đường trở thành một hiện tượng. Cậu ấy có thể trở thành cầu thủ vĩ đại của MU", Sir Alex nói khi MU chiêu mộ được Jones. Ông thậm chí so sánh Jones với huyền thoại Duncan Edwards trong lịch sử CLB.
Tuy nhiên, sự bất ổn của MU thời hậu Sir Alex và những chấn thương khiến sự nghiệp của Jones rẽ sang một hướng khác. Jones chỉ ghi được 6 bàn cho MU trong 12 năm ở câu lạc bộ, tương đương tiêu tốn hơn 8,6 triệu bảng cho mỗi bàn thắng khi tính cả phí chuyển nhượng và tiền lương tích lũy.
Trong tâm thư chia tay, Jones xúc động: "Tôi đã nghĩ rất nhiều về cách tốt nhất để nói lên nỗi lòng của mình với tất cả mọi người, và rồi cảm thấy nên nói trực tiếp với những fan đã luôn ủng hộ tôi suốt quãng thời gian ở MU".
"Chẳng bao giờ dễ dàng khi rời CLB. Tôi từng trải qua cảm giác này khi rời Blackburn. Khi đó, tôi còn rất trẻ và chẳng biết điều gì chờ đợi mình trong tương lai. Quãng thời gian của tôi ở MU thật sự tuyệt diệu. Khi chia tay Blackburn, tôi muốn chứng minh khả năng của mình. Tôi đã được đại diện cho đội bóng tuổi thơ nhưng khát khao vẫn là chơi bóng ở đẳng cấp cao nhất".
"Tôi ước gì mình có thể thi đấu nhiều hơn", Jones nghẹn ngào. "Tôi ước mình có thể cống hiến nhiều hơn cho những lứa cầu thủ mà mình được trải qua. Tôi chỉ muốn nói, từ tận đáy lòng, tôi đã làm mọi cách có thể, mọi thứ đội ngũ y tế yêu cầu, để được khỏe mạnh. Tôi không tiếc một cái gì để được khoác áo MU trở lại. Tôi đã có những tháng ngày khó khăn xa gia đình để tham gia trị liệu, hồi phục. Tôi chỉ muốn được ra sân trở lại mà thôi".
"Tôi từng chia sẻ rằng thật khó khăn để tâm sự với những đồng đội. Tôi tổn thương khi không thể giúp đỡ họ. Tôi tổn thương khi gia đình không được chứng kiến tôi thi đấu. Cảm giác như bạn khiến mọi người thất vọng".
Hiện chưa rõ quyết định tiếp theo của Phil Jones. Rất có thể cầu thủ sinh năm 1992 sẽ giải nghệ sau khi hết hợp đồng với MU.