Khi Bobby Robson rời Barca và Louis van Gaal được bổ nhiệm, Mou là người duy nhất trong bộ sậu BHL cũ được giữ lại. Từ một trợ lý ngôn ngữ thuần túy, Mou đã leo lên ghế trợ lý, phụ trách vấn đề trinh sát và phân tích đối thủ. Barca rất ấn tượng với khả năng này và đề nghị Mou ký luôn hợp đồng dài hạn, bất chấp HLV có là Van Gaal hay ai đi chăng nữa. Nhưng Mou từ chối.
Trong cuốn hồi ký, người ta được biết Mou quyết không làm trợ lý cho ai nữa là vì những vị này... dở quá. Lẽ ra lúc nên tung tiền đạo vào sân thì lại tung tiền vệ. Khi cần rút cầu thủ này thì lại đi rút người kia ra. Mou chỉ là trợ lý, những góp ý và nhận định của ông chỉ dừng lại ở mức độ tham khảo, các HLV trưởng luôn tin vào quyết định của mình, huống chi là những vị sừng sỏ như Robson hay Van Gaal.
Mourinho vô địch Champions League cùng Porto
Thế là Mou quyết định ra làm riêng để mọi người thấy khả năng của ông.
Trong năm cuối, Mou đã âm thầm tích lũy tiền bạc để đảm bảo cuộc sống
gia đình ngay cả khi thất nghiệp trong một thời gian dài. Rất may là đề
nghị từ Benfica đã đến rất nhanh. CLB này quyết định bổ nhiệm Mou sau
khi sa thải... Jupp Heynckes lừng lẫy.
Từ khởi đầu ở Benfica,
người ta đã nhận ra ngay Mou sẽ là một tay sừng sỏ trong tương lai. Ông
làm việc trong tình trạng trên đe dưới búa, chủ tịch không tạo điều
kiện, cầu thủ lười nhác vô lối, tiền bạc eo hẹp, tân binh được ký vô tội
vạ. Trước một trận đấu, đội ngũ trinh sát quan liêu của Benfica nộp cho
ông đội hình của đối thủ chỉ gồm... 10 người. Khách sạn dự kiến một
đằng, điểm đến lại là một nẻo mà lãnh đạo chả buồn báo một tiếng. Nhưng
Mou vượt qua tất cả những trở ngại khủng khiếp ấy, đưa Benfica vượt qua
cơn khủng hoảng dữ dội.
Vì biết mình giỏi nên Mou đến gặp BLĐ đòi ký hợp đồng chính thức, chứ không tạm quyền nữa. Lãnh đạo lừng khừng là Mou nghỉ ngay, tự tin là đã giỏi thì không bao giờ thất nghiệp. Lúc Mou rời Benfica, CLB đang đứng trước khả năng vô địch. Cuối mùa khi không còn Mou, Benfica rớt xuống thứ 6, thành tích tồi nhất lịch sử.
Mourinho đăng quang Premier League với Chelsea
Vì biết mình giỏi, Mou không rập khuôn theo cách cầm quân của ai mà đi
theo một con đường riêng. Ông thu nhặt kiến thức từ hai bậc thầy rồi kết
hợp với vốn hiểu biết của mình. Có lúc ông sang Brazil một tháng chỉ để
xem bóng đá, có khi ở khách sạn cả tuần xem hàng trăm băng ghi hình để
tìm hiểu cách vận hành chiến thuật. Sách bóng đá Mou đã đọc thì không
thể kể hết.