“Ngày mai (15/9) là ngày cuối cùng của tôi tại Yokohama FC”, Công Phượng mặc áo đội bóng Nhật Bản và thông báo bằng video đã được đăng tải hôm 14/9. Trên trang chủ Yokohama FC, đội bóng thông báo: “Chúng tôi xác nhận Nguyễn Công Phượng sẽ rời đội bóng. Công Phượng sẽ sang thi đấu cho một CLB ngoài Nhật Bản. Yokohama FC sẽ có thông báo ngay khi có quyết định chính thức”.
Theo Transfermarkt, Công Phượng ký hợp đồng đến thời điểm 31/1/2026. Bất chấp việc chỉ thi đấu đúng 1 phút ở cúp Hoàng đế Nhật Bản hồi năm ngoái, Công Phượng vẫn gắn bó với đội bóng này trong năm nay. Công Phượng được ra sân 2 trận ở cúp Hoàng đế Nhật Bản. Một trong số đó là đá chính. Do thi đấu quá ít nên Công Phượng không được HLV Kim Sang Sik triệu tập lên ĐT Việt Nam trong đợt FIFA Days tháng 6 và tháng 9 vừa qua.
Hiện chưa rõ Công Phượng sẽ ra đi theo diện cho mượn hay được Yokohama FC thanh lý. CLB ngoài Nhật Bản trong thông báo trên cũng chưa được xác định. Có thể, Công Phượng sẽ trở về Việt Nam. Nhưng ngay cả như vậy, tiền đạo này cũng sẽ không kịp tham dự giai đoạn 1 V.League 2024/25 do giải đấu đã khoá sổ chuyển nhượng. Như vậy, Công Phượng chỉ có thể chơi ở giải hạng Nhất, do thời hạn đăng ký cầu thủ ở giải đấu này vẫn đang diễn ra.
Trong sự nghiệp, ngoài HAGL, Công Phượng từng thi đấu cho Mito Hollyhock (Nhật Bản), Sint Truidense (Bỉ), Incheon United (Hàn Quốc), CLB TP.HCM (Việt Nam) và mới nhất là Yokohama FC (Nhật Bản). Công Phượng là cầu thủ đầu tiên trong lịch sử bóng đá Việt Nam thi đấu cho CLB nước ngoài ở 3 quốc gia khác nhau, nhưng anh đều không gặt hái được thành công.